Механізм передачі - фекально-оральний, шлях передачі - переважно водний. Є дані про поширення збудника і контактно-побутовим шляхом. Припускають можливість зараження вірусним гепатитом Е при вживанні в їжу сирих молюсків. На користь води, як головного чинника передачі інфекції, свідчать низька вогнищевість , виникнення масових захворювань, пов'язаних з сезонами дощів і з високим стоянням рівня ґрунтових вод.
Природна сприйнятливість людей висока, особливо жінок в III-му триместрі вагітності. Доказана найбільш висока природна сприйнятливість – у вагітних жінок після 30 тижня вагітності. Рідкісне ураження дітей пояснюють переважанням у них стертих субклінічних форм над маніфесними, що ускладнює їх діагностику і реєстрацію. Є достатні підстави вважати, що після перенесеного захворювання формується напружений імунітет, що зберігається, мабуть, протягом усього життя перехворів.
